Справа в тому що вода в Байкал потрапляє з найчистіших гірських джерел, струмків і річок, що впадають у нього.. На дні озера живуть губки – нерухомі істоти, дуже схожі на рослини. Вони й очищають Байкал, харчуючись завислими речовинами у воді.
Коли вона стікає з гір при таненні льодовиків, вона практично не насичується мінералами, тому що в околицях Байкалу береги річок складаються із кристалічних порід, які погано розчиняються у воді. В результаті вода залишається м'якою, тому сприятлива для пиття та купання в ній.
Чистота води підтримується завдяки ендеміці озера – рачку епіщуру. Він поглинає водорості та інші органічні речовини, пропускаючи рідину через свій організм. Крім того, він є основною їжею байкальського омуля, що також мешкає тільки в цій водоймі.
Як і губки, маленькі байкальські епішур відіграють важливу роль в екосистемі озера: вони є фільтраторами води, що очищають її.