По досягненню самочкою віку понад 1 рік в’язку припиняють. Що стосується самців, то тут все набагато простіше, хом’ячки-самці здатні спаровуватися з 5-го тижня життя, і ця здатність зберігається практично протягом усього їхнього життя.
Розмноження У природному середовищі існування джунгарські хом’яки розмножуються з березня до вересня, в неволі вони розмножуються цілий рік. У посліді може бути від 1 до 11 дитинчат. Статева зрілість настає з 4-6 тижнів, проте занадто рання вагітність може бути дуже небезпечною для самки.
Оченята у дитинчат відкриваються трохи раніше, ніж у сирійських хом’ячків, – на 10-й день. У віці 20 днів молодих “джунгариків” можна відокремлювати від матері.